Mattilsynet er et jord-til-bord tilsyn, det vil si at det følger matvarene gjennom hele produksjonskjeden fra innsatsvarer til ferdig mat. Mattilsynet har i tillegg ansvar for en del andre områder som drikkevann, kosmetikk, kjæledyr og prydplanter.
Mattilsynet ovetok i januar 2004 forvaltningsoppgavene til Statens dyrehelsetilsyn, Statens næringsmiddeltilsyn, Statens landbrukstilsyn, de kommunale næringsmiddeltilsynene og deler av Fiskeridirektoratet.
Mattilsynet består av ett hovedkontor, åtte regionkontorer og 55 distriktskontor fordelt på om lag 70 kontorsteder.
Flere av regionkontorene har spesielle kompetanseområder og ansvarsoppgaver:
- Bergen har særskilt kompetanse innen fiskefôr, sjømatproduksjon, fiskehelse og bearbeiding av sjømat.
- Ås har særskilt kompetanse innen planteproduksjon, plantehelse, plantevernmidler, fôr og bearbeiding av vegetabilsk mat.
- Sandnes har særskilt kompetanse innen husdyrproduksjon og bearbeiding av mat fra landdyr, samt innen dyrehelse og dyrevelferd.
- Sortland har driftsansvar for administrative oppgaver som økonomi,lønn og avgiftsinnkreving.
- Ringsaker har driftsansvar for IKT og sentralarkiv.